حذر المعهد الألماني لتقييم المخاطر من احتواء مشروبات اللوز على السم الفطري "أفلاتوكسين بي 1"، الذي قد يسبب السرطان عبر إحداث طفرات وراثية، ما يجعله خطراً على الأطفال دون سن السادسة، وأظهرت الدراسة وجود ملوثات أخرى في مشروبات الشوفان والصويا.
وعلى الرغم من تصنيف خطرها بالمنخفض أو المتوسط، إلا أن تراكمها مع منتجات أخرى يثير القلق. لذا، يوصي الخبراء بعدم الاعتماد الكلي على البدائل النباتية كبديل لحليب الأبقار، مع ضرورة اتباع نظام غذائي متنوع لتقليل تعرض الأطفال لهذه السموم الضارة.