للإفراط بإستخدام المضادات الحيوية مشاكل خطيرة على الصحة، إذ يؤدي إلى تطور قدرة البكتيريا على مقاومة هذه الأدوية، ما يجعل علاج العدوى أكثر صعوبة.


فالإفراط في إستخدام المضادات الحيوية يؤدي إلى تطور قدرة البكتيريا على المقاومة، وإلى قتل البكتيريا النافعة، بالإضافة إلى أن له آثاراً جانبية، منها الغثيان، الإسهال والطفح الجلدي، وتصل أحياناً إلى تلف الكبد والحساسية المفرطة.
ومن الأعراض التي تؤكد على الإفراط في إستخدام المضادات الحيوية، نذكر:
إضطرابات في الجهاز الهضمي، الحساسية والتفاعلات الجلدية، ضعف المناعة، مشاكل الكلى والكبد مثل إجهاد الكبد أو تلف الكلى، واضطرابات الجهاز العصبي.